新车配备了三温区自动空调，控制面板由实体旋钮及按键组成，手感和操作便利性都很出色。后排空调的控制面板位于出风口下方，配有一个小尺寸显示屏，能够显示温度信息。不过由于位置偏低，因此交互感受还有提升空间。配置方面，宝马iX3还配有车内PM2.5过滤装置，这对于北方的朋友们来说无疑是非常实用的配置。
宝马iX3主副驾驶座椅均支持电动调节，此外还配有手动调节的伸缩腿托，而像是前排座椅腰部支撑、加热以及主驾驶位座椅记忆也都是非常实用的配置。座椅采用真皮材质包裹，填充柔软且支撑良好，乘坐感受十分舒适。后排座椅靠背支持角度调节，并且两侧还提供“航空头枕”，倚靠十分舒适。可开启式全景天窗采光效果很好，能够为车内带来通透的视野，但美中不足的是，可开启的面积有些小。
